公司培训合同合法。用人单位与员工依法签订的培训协议具备法律效力，签订培训合同后，用人单位应当为劳动者提供专项培训费用，并对其专业技能进行培训。
一、
公司培训合同是否合法
公司组织员工培训，并和员工签培训协议是合法有效的。用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。公司组织员工进行培训，不能收取培训费，但劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
二、
培训合同违约金标准是什么
违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。找法网提醒您， 用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。 企业要求员工支付违约金不得超过用人单位提供的培训费用，而且不能超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。 培训费用的界定也有明确之规定，不能凭空捏造或假设推测。
《中华人民共和国劳动合同法》 第二十二条 第二款 劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。 违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。 用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
三、
违约责任条款是否独立于合同
可以独立，不是一定独立。
《中华人民共和国民法典》第四百七十条 【合同主要条款与示范文本】合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
（一）当事人的姓名或者名称和住所；
（二）标的；
（三）数量；
（四）质量；
（五）价款或者报酬；
（六）履行期限、地点和方式；
（七）违约责任；
（八）解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。其中违约责任并非必须有的内容，所以违约责任条款可以独立于合同。