总公司注册分公司的流程包括企业相关负责人到工商局办理前置手续，并填写分公司设立登记申请书，由总公司盖章并由法定代表人签字，注册分公司的材料有分公司营业场所使用证明、营业执照、国税、地税登记证等资料。
一、总公司注册分公司流程
总公司注册分公司，需要经过以下的流程：
1.持“企业名称预先核准申请书”、“授权书”及商标注册证复印件到工商局办理核名。
2.核名后，持工商局发给的核名通知书到相关部门办理前置审批手续。
3.填写《分公司设立登记申请书》。
4.填写《指定代表或者共同委托代理人的证明》。
5.准备分公司营业场所使用证明;自有房产提交产权证复印件。
6.由总公司出具的股东会决议，决议内容须有分公司负责人的任职决定，同时提供负责人的身份证复印件。
7.持验资报告、房产证、授权书、股东会决议等到工商局办理营业执照。
8.持营业执照及公司设立通知书到公安局办理刻章业务。
9.持国税、地税登记证、营业执照等资料到开户行办理正式开户。
提醒您，需要办理一般纳税人时，持办理完的相关证件及税务机关要求报送的其他资料到主管国税机关进行办理。
二、总公司注册分公司需要什么材料
总公司注册分公司需要以下的材料：
核分公司名称，成功后，打印出来，第一页全体投资人《合伙人》签字处由总公司签字。
1.名称预先核准通知书
2.企业设立申请表
3.总公司的营业执照副本复印件加盖公章
4.总公司的公司章程加盖公章
5.《企业秘书(联系人)登记表》
6.填写委托书《法人签字》
具体的资料，需要根据工商部的要求进行准备。
三、分公司网上注册流程
分公司网上注册流程如下：
1.注册网上注册系统用户。
2.选择申办业务类型。
3.根据提示，填写申请相关信息。
4.上传文件。目录中如果缺少需提交文件名称可通过“添加材料”按钮，自行录入材料名录，增加材料目录信息。
5.查看反馈。
6.现场交件。
7.纸质材料被审查同意后，领取核准通知书、纸质营业执照、电子营业执照。