劳动合同关系终止取得一次性经济补偿收入应纳个人所得税。补偿金数额按照工作时间长短方式赔偿员工。如果劳动者工作未满六个月按照半个月工资补偿；每满一年按照一个月工资赔偿。这里的月工资标准为劳动者离职前十二个月的平均月工资，且赔偿年限最高为十二年。
一、劳动合同终止经济补偿金的个税
劳动合同终止经济补偿金的个税的规定为，根据《财政部、国家税务总局关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》（财税[2001]157号）规定：
“（一）个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税;超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》（国税发[1999]178号）的有关法规，计算征收个人所得税。
（二）个人领取一次性补偿收入时按照国家和地方政府法规的比例实际缴纳的住房公积金、医疗保险费、基本养老保险费、失业保险费，可以在计征其一次性补偿收入的个人所得税时予以扣除。
二、终止劳动合同终止哪三种情况可得经济补偿
市劳动和社会保障局劳动关系处处长李文华称，终止劳动合同时维护劳动者的权益，这是《劳动合同法》与《劳动法》相比又一个重大发展。
《劳动合同法》明确规定，终止劳动合同有三种情况应支付经济补偿：劳动合同期满；用人单位依法宣告破产的；用人单位被吊销营业执照，责令关闭、撤销或决定提前解散的。
按照现行《劳动法》规定，只有解除劳动合同时才支付补偿金。而劳动合同到期自然终止则不用支付补偿金。而新法中规定，劳动合同期满不再续签单位要补偿员工，除非是单位以不低于原待遇水平续约员工、但是员工不愿意续签的。
新《劳动合同法》第四十七条主要规定了劳动合同解除或终止的工龄经济补偿金问题，新法与现行法规相比，在经济补偿金的计算标准上有了突破。高薪劳动者补偿标准按当地职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。而对一般劳动者则按实际工资补偿，且无十二年的限制。这体现了对一般劳动者的倾斜保护，避免在经济补偿金标准上出现过分悬殊。
三、终止劳动合同经济补偿金怎么计算
终止劳动合同属于《劳动合同法》第四十六条情形之一的，经济补偿按按劳动者在本单位工作的年限计算：每满一年支付一个月工资的标准；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资。